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- 天津工生所在基于轉(zhuǎn)錄調(diào)控因子的生物傳感器研究方面取得進(jìn)展
- 來(lái)源：天津工業(yè)生物技術(shù)研究所 發(fā)表于 2023/2/14
微生物育種技術(shù)正朝著自動(dòng)化、標(biāo)準(zhǔn)化和系統(tǒng)化的方向發(fā)展，在短時(shí)間內(nèi)將設(shè)計(jì)構(gòu)建獲得大量工程菌種，如何快速、準(zhǔn)確地篩選到目標(biāo)高產(chǎn)菌種是工業(yè)菌種迭代的關(guān)鍵限速步驟。生物傳感器可將目標(biāo)化合物的濃度信號(hào)轉(zhuǎn)化為熒光等易于檢測(cè)的信號(hào)，是菌種高通量篩選的重要工具。基于轉(zhuǎn)錄調(diào)控因子（Transcriptional factor，TF）的生物傳感器被廣泛應(yīng)用于菌種的高通量篩選和代謝途徑的動(dòng)態(tài)調(diào)控。然而，天然TF的傳感性能往往難以滿(mǎn)足實(shí)際應(yīng)用需求，目前主要通過(guò)定向進(jìn)化或理性改造效應(yīng)物結(jié)合域來(lái)提高其傳感性能，但由于效應(yīng)物結(jié)合域一般超過(guò)200個(gè)氨基酸，建庫(kù)篩選的難度較大，且突變易改變其效應(yīng)物響應(yīng)特異性，因此急需發(fā)展更加簡(jiǎn)便、有效、通用的TF型生物傳感器設(shè)計(jì)改造策略。
中國(guó)科學(xué)院天津工業(yè)生物技術(shù)研究所研究員鄭平團(tuán)隊(duì)等以原核生物中轉(zhuǎn)錄調(diào)控因子家族——LTTR家族的LysG和BenM為研究對(duì)象，通過(guò)分子對(duì)接、分子動(dòng)力學(xué)模擬和定向進(jìn)化等技術(shù)解析了效應(yīng)物結(jié)合域與DNA結(jié)合域間的鉸鏈區(qū)的調(diào)控功能及其調(diào)控機(jī)制。研究進(jìn)一步對(duì)僅包含約30個(gè)氨基酸的鉸鏈區(qū)進(jìn)行定向進(jìn)化，可快速獲得響應(yīng)性能顯著提升的突變體，從而開(kāi)發(fā)了一種TF型生物傳感器設(shè)計(jì)改造與性能提升的通用策略。該策略應(yīng)用于堿性氨基酸生物傳感器LysG的改造提升，獲得的LysG突變體在賴(lài)氨酸合成關(guān)鍵酶的高通量篩選和合成途徑的動(dòng)態(tài)調(diào)控中展示出更好的應(yīng)用效果。
相關(guān)研究成果于近日發(fā)表在Biosensors & Bioelectronics上。研究工作得到國(guó)家研發(fā)計(jì)劃、國(guó)家自然科學(xué)基金、天津市合成生物技術(shù)創(chuàng)新能力提升行動(dòng)、天津市合成生物學(xué)海河實(shí)驗(yàn)室顛覆性創(chuàng)新類(lèi)項(xiàng)目等的支持。
LysG蛋白結(jié)構(gòu)的分子動(dòng)力學(xué)模擬揭示鉸鏈區(qū)的調(diào)控功能
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